Хилари бактерии что это такое: диагностика и лечение заболеваний, которые она вызывает, в клинике МЕДСИ в Санкт-Петербурге

диагностика и лечение заболеваний, которые она вызывает, в клинике МЕДСИ в Санкт-Петербурге

Оглавление

Бактерия Helicobacter pylori относится к грамотрицательным спиралевидным микроорганизмам и обычно «поселяется» в антральной части желудка. Продукты ее жизнедеятельности способны вызывать развитие эрозивно-язвенных, воспалительных или атрофических процессов в слизистой оболочке желудка или двенадцатиперстной кишки и провоцируют такие заболевания, как язвенная болезнь, гастрит, дуоденит и рак.

По оценкам различных авторов, во всем мире инфицированность этим микроорганизмом достигает более 60 % (15-25 % в странах Европы и Северной Америки и более 90% в странах третьего мира). В России инфицированность взрослого населения колеблется от 65% (Санкт-Петербург) до 92% Москва, Красноярск). Считают, что Helicobacter pylori распространился из Восточной Африки около 58000 лет назад. В настоящее время в 27 регионах мира выявлено 370 штаммов Helicobacter pylori.

В России преобладает штамм НрAsia2 (индийский геном).

История

Первые сведения об данном микроорганизме даны немецкими учеными в 1875 г. (бактерия не росла на известных в то время искусственных питательных средах, и это случайное открытие было забыто). Потом имеются упоминания в работах 1886 года профессора Валерия Яворского из Ягеллонского университета (назвал обнаруженную им бактерию Vibrio rugula и был первым, кто предположил возможную этиологическую роль этого микроорганизма в патогенезе заболеваний желудка), в 1974 г. в работах профессора И. А. Морозова (обнаружил спиралевидные бактерии в материале больных после ваготомии во внутриклеточных канальцах клеток желудка, а также у больных язвой, которым не делали ваготомию). Бактерия была вновь открыта в 1979 году австралийским патологом Робином Уорреном, который затем провёл дальнейшие исследования её вместе с Барри Маршаллом. Уоррену и Маршаллу удалось выделить, изолировать и культвировать этот микроорганизм из проб слизистой оболочки желудка человека.

Они высказали предположение, что большинство язв желудка и гастритов у человека вызываются инфицированием микроорганизмом Helicobacter pylori, а не стрессом или острой пищей, как предполагалось ранее. В 2005 году ученые Робин Уоррен и Барри Маршал получили Нобелевскую премию за открытие истинных механизмов развития этих недугов.

Протекание болезни

После попадания в желудок H. pylori, двигаясь при помощи жгутиков, преодолевает защитный слой слизи и колонизирует слизистую оболочку желудка. Закрепившись на поверхности слизистой, бактерия начинает вырабатывать уреазу, благодаря чему в слизистой оболочке и слое защитной слизи поблизости от растущей колонии растёт концентрация аммиака и повышается pH. По механизму отрицательной обратной связи это вызывает повышение секреции гастрина клетками слизистой желудка и компенсаторное повышение секреции соляной кислоты и пепсина, с одновременным снижением секреции бикарбонатов.

Эндотоксин VacA, вырабатываемый бактерией, вызывают вакуолизацию и гибель клеток эпителия желудка. Продукты гена СagA вызывают дегенерацию клеток эпителия желудка, вызывая изменения их фенотипа клеток. Привлечённые воспалением лейкоциты вырабатывают различные медиаторы воспаления, что приводит к прогрессированию воспаления и изъязвления слизистой. Таким образом запускается механизм воспалительных и эрозивно-язвенных изменений в слизистой оболочке желудка и двенадцатиперстной кишки и программируемой клеточной гибели клеток эпителия желудка с запуском каскада изменений слизистой желудка (каскад Cоrrea) – нормальная слизистая – атрофия слизистой желудка – метаплазия – дисплазия – рак. Эксперты Всемирной Организации Здравоохранения признали микроорганизм Helicobacter pylori абсолютно доказанным канцерогеном 1 класса. В России ежегодно регистрируется более 37000 новых случаев рака желудка. Эта патология заняла четвертое место среди опухолевых заболеваний и второе место по структуре смертности от онкологической патологии.

Диагностика и лечение

По Киотскому консенсусу, консенсусу Маастрихт V, рекомендаций Российской гастроэнтерологической ассоциации рассмотрены вопросы диагностики и оптимизации эрадикационной терапии Нр.

Стратегия «тестируй на Helicobacter pylori и лечи» признана наиболее эффективной мерой профилактики некардиального рака желудка, лечения язвенной болезни и гастрита. Существующие неинвазивные (дыхательный уреазный тест, 13С – уреазный дыхательный тест, определение антигенов НР в кале, ПЦР НР в кале) и нвазивные (серологический метод исследования антител НР в крови, быстрый уреазный тест (проводится при ФГДС в биоптате слизистой желудка), бактериологическое исследование на НР, микроскопическое исследование биоптата слизистой желудка на НР) тесты диагностики позволяют с разной точностью диагностировать инфицированность Helicobacter pylori. Согласно международным согласительным рекомендациям по диагностике и лечению болезней, ассоциированных с хеликобактером золотым стандартом определения хеликобактериоза, является сочетание уреазного дыхательного теста с определением хеликобактерного антигена в кале при помощи иммуноферментного анализа. Эрадикация H. pylori устраняет воспалительный ответ слизистой желудка, приводит к обратному развитию атрофии желудка, если нет кишечной метаплазии, останавливает прогрессирование повреждения слизистой желудка до предраковых изменений и в рак.

Эрадикация H. pylori с целью профилактики рака желудка является оправданной в областях с высоким и средним риском рака желудка и у пациентов с повышенным риском рака желудка, является рациональной в областях с низким риском рака желудка.

Есть ли у Вас инфекция Хеликобактер пилори? — Гастроэнтерология — Отделения

Есть ли у Вас инфекция Хеликобактер пилори?

Хеликобактер пилори – бактерия, обитающая на слизистой оболочке желудка и двенадцатиперстной кишки и вызывающая ее воспаление и повреждение. Она является основной причиной развития хронического гастрита, язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки, а также рака желудка.

Хеликобактер пилори является одной из наиболее частых хронических инфекций человека. В России ей инфицировано до 80% взрослого населения.

Заражение обычно происходит в детском возрасте. При этом иммунитет человека не справляется с уничтожением Хеликобактер пилори. Без лечения эта бактерия практически всегда остается в желудке на протяжении всей жизни.

Вопреки частому заблуждению Хеликобактер пилори не является безвредным микроорганизмом. При его наличии всегда развивается хронический гастрит, на фоне которого в дальнейшем могут возникать язвы и рак.

Какие симптомы могут быть обусловлены хроническим воспалением слизистой желудка, ассоциированной с Хеликобактер пилори?

• Боль и дискомфорт в области желудка
• Тяжесть в области желудка после еды
• Тошнота, рвота, снижение аппетита
• Рвота с кровью и темный стул (следствия язвенного кровотечения)

В каких ситуациях важно выявить Хеликобактер пилори?

• При хроническом поверхностном и атрофическом гастрите, в том числе эрозивном
• При обострении язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки
• Если язвенная болезнь выявлялась в прошлом
• В случае длительного приема препаратов, снижающих кислотность желудочного сока (ингибиторы протонной помпы)
• При регулярном приеме болеутоляющих и противовоспалительных препаратов (нестероидных противовоспалительных препаратов)
• Если близкий родственник болел раком желудка
• Если имеются некоторые заболевания крови (идиопатическая тромбоцитопеническая пурпура, железодефицитная анемия с неясной причиной)

Как можно выявить Хеликобактер пилори?

Имеется несколько методов диагностики Хеликобактер пилори.

Наличие бактерии можно определить при проведении гастроскопии, а также без нее с помощью специального дыхательного теста, анализов крови и кала.

Выбрать оптимальный метод может врач.

Как можно вылечить инфекцию Хеликобактер пилори?

Для лечения Хеликобактер пилори назначаются специальные схемы из 3-5 препаратов, содержащие в своем составе антибиотики. Длительность терапии обычно составляет 10-14 дней. Назначить лечение может только врач. При подборе схемы важно учитывать ранее проводившееся лечение Хеликобактер пилори, наличие аллергии, предшествующий прием антибиотиков, применение других лекарств.

Что может дать уничтожение инфекции Хеликобактер пилори?

• Вылечить хронический гастрит
• Остановить прогрессирование атрофии слизистой оболочки желудка
• Прекратить повторяющиеся обострения язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки
• Снизить риск развития рака желудка
• Уменьшить вероятность повреждения слизистой оболочки при приеме болеутоляющих и противовоспалительных препаратов (нестероидных противовоспалительных препаратов)
• Улучшить показатели крови при тромбоцитопенической пурпуре и железодефицитной анемии неясной этиологии

Как проконтролировать эффективность лечения инфекции Хеликобактер пилори?

Контроль эффективности лечения необходимо провести через месяц после окончания терапии. Выбрать оптимальный метод поможет врач.

Надо ли Вам провериться на хеликобактер?

Чек-лист для пациентов

Мы собрали признаки, которые указывают на вероятность заражения инфекцией.

Если Вы дали положительный ответ на 3-4 признака — рекомендуем пройти обследование и обратиться к врачу.

Это про Вас?

☑ Боли в верхних отделах живота после еды

☑ Чувство раннего насыщения, тяжесть после еды

☑ Тощаковые боли в верхних отделах живота (ночью или при больших перерывах между едой)

☑ Отсутствие аппетита по утрам

☑ Изжога, отрыжка

☑ Частое посещение мест общественного питания

☑ Наличие родственников с гастритом или язвенной болезнью

анализ на хеликобактер, тест на хеликобактер

 

В клинике Мединеф можно сделать Хелик Тест (анализ на Хеликобактер) на новейшем аппарате тест-система “Хелик- скан”

Тест-система Хелик-скан с индикаторной трубкой — это одноразовое устройство (индикаторная трубка) и компрессор. Тест-система позволяет проводить неинвазивную специфическую экспресс-диагностику инфекции Helicobacter pylori по составу выдыхаемого воздуха с высокой точностью и без привлечения лаборатории

Инструкцию по подготовке к хелик-тесту Вы можете получить и распечатать здесь: Подготовка к хелик-тесту

Новые подходы в диагностике гастрита и язвы. Хеликобактер – основная причина гастрита и язвы

Ученые утверждают, что у людей, страдающих язвой и гастритом, неоправданно часто плохое, подавленное настроение. И это немудрено, ведь от того, насколько исправно желудок справляется с пищей, зависит работа всего организма и нервной системы в том числе. Всему виной бактерия хеликобактер .

С чего всё начинается

Гастрит и язва, как правило, следствие появления в организме бактерий хеликобактер . Чтобы заразиться, достаточно не помыть руки перед едой, перекусить на ходу яблоком прямо с прилавка, или войти в близкий контакт с носителем бактерий хеликобактер .

Симптомы гастрита и язвы

Признаки заболевания могут появиться не сразу. Хеликобактер активизируются в момент ослабления организма, во время сбоев защитной реакции иммунной системы. Стресс, изменения в питании или ангина способствуют обострению болезни. Пациента мучает отрыжка, боли в животе, чувство жжения и тошнота. Эти неприятные и болезненные ощущения обусловлены повысившейся кислотностью желудочного сока, что является следствием деятельности хеликобактер . Слизистая оболочка желудка воспаляется, на поверхности появляются маленькие язвочки, становящиеся причиной больших проблем, при отсутствии лечения.

Лечение хеликобактер : особенности воздействия

Хеликобактери пилори представляет собой бактерию, которая находится у пациентов, страдающих заболеванием двенадцатиперстной кишки и желудка. Название бактерии происходит от двух слов: «пилори», что указывает на место обитания данной бактерии – пилорический желудочный отдел, а также «хелико», что является отображением ее формы: спиралевидной, винтообразной.

Робин Уоррен и Барри Маршал стали первыми докторами, которые обнаружили хеликобактер . За это в 2005 году они получили нобелевскую премию. По нескольким причинам открытие хеликобактер можно назвать действительно революционным:

1. Было выяснено, что кислая среда обитания в желудке для бактерии хеликобактер не помеха, она прекрасно там выживает и вызывает большинство желудочных заболеваний. Ранее считалось, что бактерии в такой кислой среде не выживают. Но, тем не менее, прием антибиотиков способен вылечить большинство желудочных заболеваний.

Итак, первая особенность, которая присуща хеликобактер пилори, – способность противостоять кислой желудочной среде. Сопротивление кислотности происходит за счет двух механизмов.

Когда в желудок поступает пища, хеликобактер пилори перемещается при помощи жгутиков и скрывается в слизи, которая является защитой для клеток и покрытием стенок желудка.
Хеликобактер действует в виде усилителя защитной секреции аммиака, которая нейтрализует кислотную среду в желудке.
Хеликобактер пилори закрепляется на желудочных стенках и может не один десяток лет благополучно там существовать.

2. Вторая особенность хеликобактер пилори – именно она представляет собой основную причину заболеваний двенадцатиперстной кишки и желудка. При размножении данная бактерия способна разрушительно действовать на наш желудок. Из-за того, что высвобождаются вредные вещества, начинаются хронические воспаления как результат – гастрит. Кроме того, когда слизистая оболочка двенадцатипертсной кишки и желудка ослабляется, в итоге появляется язва, а также вполне возможно возникновения рака желудка. На сегодняшний день хеликобактер пилори – основная причина развития раковых опухолей в желудке.

3. Третья особенность – бактерию хеликобактер пилори можно уничтожить посредством антибиотиков, а также иных лекарств, которые способны регулировать уровень кислотности в желудке. Можно сказать, что есть две основные причины, по которым люди, имеющие желудочные заболевания, должны провериться, есть ли у них хеликобактер пилори:

эта бактерия может вызвать весьма серьезные заболевания;
хеликобактер пилори устойчива к кислотной среде и может благополучно в ней существовать на протяжении десятилетий.
Единственный метод предотвратить развитие и существование хеликобактер пилори – эффективное лечение антибиотиками и прочими специальными лекарствами.

Диагностика гастрита и язвы — анализ на хеликобактер

Как известно, правильный и вовремя поставленный диагноз — это 50% успеха. Но многие обследования неприятны, болезненны и требуют определенного времени.

Врачи клиники «МЕДИНЕФ» спешат обрадовать своих пациентов: применять зонд для обследования желудка уже нет необходимости. Теперь достаточно сдать анализ на хеликобактер (тест на хеликобактер) с помощью нового абсолютно безболезненного метода. Пациенту достаточно в течение некоторого времени подышать в диагностический газовой анализатор, и в считанные минуты будет известно, есть ли в желудке больного возбудитель гастрита и язвы — бактерия хеликобактер .

Результат анализа на хеликобактер помогает врачу подобрать каждому пациенту индивидуальное лечение, и впоследствии контролировать его эффективность. Важность диагностики наличия хеликобактер таким методом трудно переоценить. Он позволяет абсолютно безболезненно определить наличие возбудителей заболевания желудочно-кишечного тракта.

---

---

Вы можете записаться на прием по телефону: 8 (812) 603-03-03

Мы находимся по адресу г. Санкт-Петербург, ул. Боткинская д. 15,  к. 1 
(5 минут ходьбы от ст. м. Пл. Ленина, выход на ул. Боткинская).

Хеликобактер пилори: мифы и реальность

  Helicobacter pylori (хеликобактер пилори, в дальнейшем — НР) —  бактерия, которая инфицирует различные области желудка и двенадцатиперстной кишки, вызывая в слизистой оболочке изменения, приводящие к развитию гастрита, язвы, рака.

   Международное агентство по изучению рака (IARC) отнесло НР к канцерогенам первой группы (определенный канцероген). НР — не единственный этиологический фактор рака желудка, но он играет причинную роль в цепи событий, ведущих к его развитию.

  Следует отметить, что заболеваемость раком желудка в Беларуси достаточно высока, в Европейском регионе в 2016 г. мы занимали первое место по этому показателю, в 2017 году второе. Именно поэтому стратегия поголовного лечения этой инфекции является абсолютно оправданной, это действительно сохраняет чьи-то реальные жизни в перспективе.

  Бактерия была вновь открыта в 1979 году австралийским патологом Робином Уорреном, который затем провёл дальнейшие исследования её вместе с Барри Маршаллом, начиная с 1981 года.

  Уоррен и Маршалл высказали предположение, что большинство язв желудка и гастритов у человека вызываются инфицированием микроорганизмом НР, а не стрессом или острой пищей, как предполагалось ранее.

  В 2005 году  Робин Уоррен и Барри Маршалл были удостоены Нобелевской премии по медицине за открытие НР.

Сколько же людей в Беларуси инфицировано?

  Около 80% взрослого населения Беларуси заражены НР, а в странах Западной Европы и США — 30—40%. Такой же уровень заражения НР, как в нашей стране, наблюдается в Украине и России.

  В Японии, где отмечается высокая заболеваемость раком желудка, существует национальная программа по эрадикации HР (пациенты получают препараты для эрадикации бесплатно), что позволило значительно снизить не только количество носителей НР в популяции, но и заболеваемость раком желудка.

Каким образом можно заразиться НР-инфекцией?

  В первую очередь, следует отметить, что заражение в основном происходит в семьях, в случаях, если инфицированы родители, инфицируются и дети. Заражение может происходить  через столовые приборы и посуду, а также пустышку или бутылочку, в случае с маленькими детьми, через слюну и прочие слизистые выделения, например, при поцелуе;  через предметы индивидуальной гигиены и личную косметику (губную помаду).

  Поскольку носителями различных видов НР являются домашние животные (собаки, кошки) – важно соблюдение мер личной гигиены при общении с ними.

  Также возможны случаи заражения  через медицинское оборудование, после обследования больного.

Всегда ли нужно лечить НР-инфекцию?

  Существуют определенные ситуации, в которых обязательно нужно проводить эрадикацию НР:

— Язва 12-перстной кишки и/или желудка в настоящее время или в прошлом

— Лимфома желудка

— Атрофический (аутоиммунный) гастрит

— У пациентов – родственников 1-й степени родства (мать, отец, братья, сестры) больных раком желудка

— Диспепсия (наличие жалоб, связанных с желудком)

— Желание пациента

  В любом случае врач всегда должен найти общий язык с пациентом, объяснить ему, зачем назначает эрадикационную терапию, и только после этого назначать лечение.

Какие схемы лечения лучше использовать?

  В 2016-2017 годах было принято несколько глобальных соглашений по диагностике и лечению НР-инфекции: это Маастрихтское соглашение,  Киотский консенсус. Врачи и эксперты всего мира договорились о стратегии, выработали тактику для более успешного выявления и лечения этой инфекции.

  Схемы лечения легко найти в интернете, однако самостоятельно назначать себе лечение не стоит. Лучше предварительно проконсультироваться с участковым терапевтом, который и должен назначить вам схему лечения с учетом индивидуальных особенностей (аллергия на лекарственные препараты, наличие сопутствующих заболеваний, прием антибактериальных препаратов в анамнезе).

  Если раньше схема эрадикации по длительности занимала 7-10 дней, то по последним рекомендациям – продолжительность ее  увеличилась до 14 дней. Это повышает вероятность  успеха в лечении.

  Также для улучшения переносимости эрадикационных схем и уменьшения вероятности развития побочных эффектов, таких, как антибиотик-ассоциированная диарея,  рекомендуется параллельно с антибиотиками принимать препарат из группы пробиотиков (энтерол, энтерожермина и др. ).

Нужно ли делать контроль после лечения и каким образом?

  Последние вышедшие клинические протоколы диагностики и лечения заболеваний органов пищеварения рекомендуют проводить контроль эрадикации НР после лечения. Способы могут быть разными – это либо гастроскопия с взятием биопсии (морфологический контроль является «золотым стандартом»), либо проведение дыхательного теста, а также определение антигенов НР в кале.

  В нашей стране сейчас доступны разные виды дыхательных тестов для определения наличия НР, однако наиболее надежным является С13-УДТ (С13-уреазный дыхательный тест), который проводится с помощью газоанализатора, в основном в РБ используются аппараты немецкой фирмы FAN. Определение антигенов НР в кале в Минске пока недоступно, однако в некоторых городах РБ этот анализ можно сделать.

 

Врач-гастроэнтеролог консультационного отделения   

О.С. Полякова

Хеликобактер. Нужно ли лечение? — amcclinic.ru

15.05.2018

Согласно проведенным исследованиям было установлено, что бактерия хеликобактер пилори — причина развития многих заболеваний желудочно-кишечного тракта: язвы желудка и двенадцатиперстной кишки, гастрита. Helicobacter pylori под влиянием определенных факторов провоцирует развитие патологий. Возникает вопрос, нужно ли лечить хеликобактер пилори или оставить этот микроорганизм в покое?

При каких симптомах и заболеваниях нужен дыхательный тест на хеликобактер

Основные симптомы, при которых гастроэнтерологи рекомендуют записаться на дыхательный тест на хеликобактер:

• изжога и тошнота;

• рвота;

• неприятный запах из ротовой полости;

• болезненные ощущения в верхней и нижней части живота;

• множественные аллергические реакции;

• частые головные боли.

Если вы заметили такие симптомы у себя или своих близких, срочно запишитесь на прием к врачу, который при необходимости, направит вас на этот анализ.

Лечение при выявлении бактерии хеликобактер пилори

При диагностировании язвы двенадцатиперстной кишки и желудка назначается медикаментозное лечение. Курс антибактериальной терапии рекомендуется всем ближайшим родственникам больного, у которого выявлена онкология желудка. Лечение также проходят те пациенты, у которых не хватает в организме железа и развита анемия.

Курс лекарственной терапии включает прием минимум трех препаратов, два из которых — это антибиотики. Кроме антибиотиков, пациенту назначается медпрепарат — ингибитор протонной помпы и дополнительные витамины. Врачи называют такой метод терапии «тройной схемой лечения». По прошествии двух недель пациент снова сдает анализ на предмет наличия в его организме хеликобактер пилори. Если она присутствует, курс терапии повторяют снова.

Кроме лекарственной терапии, доктор контролирует рацион питания больного и его образ жизни. Настоятельно рекомендуется исключить стрессовые факторы и вредные привычки, включить в рацион больше фруктов и овощей, исключить жареную, острую, копченую пищу, а также мучные продукты и сладкое.  

Как уже отмечалось ранее хеликобактер пилори не всегда является причиной возникновения гастрита, язвы и онкологии желудка. Здоровый иммунитет может контролировать концентрацию этой бактерии при ее наличии в организме. Для профилактики развития расстройств, связанных с helicobacter pylori, следует придерживаться здоровой диеты и исключить из рациона те продукты, которые приводят к раздражению слизистой желудка — специи, острые приправы, маринады, газированные напитки, слишком кислые овощи и фрукты, алкогольные напитки и кофе.   

Самое главное, чтобы человек не занимался самолечением и самодиагностикой, а при первых симптомах обратился за квалифицированной помощью к врачу. Отсутствие своевременной терапии может привести к развитию онкологии желудочно-кишечного тракта.

Лечить хеликобактерную инфекцию в Москве

Хеликобактер пилори (Helicobacter pylori) – это бактерии, которые живут на слизистой оболочке желудка человека. Эти бактерии способны продуцировать и высвобождать большое количество ферментов и токсинов, которые способствуют повреждению клеток слизистой оболочки, что может приводить к развитию воспалительных и язвенных заболеваний желудка и двенадцатиперстной кишки. При этом известно, что почти 60% населения земного шара инфицированы хеликобактером. Следовательно, далеко не каждый инфицированный человек заболевает язвенной болезнью, однако, среди заболевших у большинства выявляется данная инфекция , которая способствует развитию язвенной болезни. В настоящее время доказано, что наличие хеликобактерной инфекции при воспалительных заболеваниях желудка и двенадцатиперстной кишки является показанием к назначению антибактериальной терапии.

Причины заболевания

Хеликобактер пилори обитает только в желудке человека. Заражение происходит при контакте с инфицированным человеком. Передача инфекции может происходить при поцелуях или использовании одной посуды, а также через предметы гигиены. Как правило, все члены семьи бывают инфицированы одним штаммом Хеликобактер пилори, что доказывает контактно-бытовой путь передачи.

Симптомы заболевания

Часто хеликобактерная  инфекция может протекать бессимптомно. Выявление Хеликобактер пилори в отсутствие воспалительных заболеваний желудка или кишечника не является показанием к назначению антибактериальной терапии. При развитии на фоне хеликобактерной инфекции воспалительных заболеваний( язва желудка или двенадцатиперстной кишки, эрозивный гастрит, гастродуоденит) клиническая картина будет соответствовать заболеванию.

Доктора данного направления

Диагностика

Диагностика хеликобактерной инфекции возможна при использовании целого ряда методов, которые позволяют выявить сам микроорганизм, признаки его жизнедеятельности или иммунологический ответ организма на инфекцию (антитела в сыворотке крови). Как правило, при обнаружении активного воспалительного процесса в желудке или двенадцатиперстной кишке, пациента направляют на обследования для исключения хеликобактерной инфекции.

1. Обнаружение специфических антихеликобактерных антител классов в крови больного.
2. Дыхательный тест на хеликобактер пилори с регистрацией продуктов жизнедеятельности (углекислый газ, аммиак)
3. Обнаружение ДНК бактерии методом ПЦР в анализах кала, слюны, зубном налете.
4. Обнаружение микроорганизмов при микроскопическом исследовании биоптата слизистой оболочки, взятого при ФЭГДС.

Из всех перечисленных методов обследования для первичной диагностики рекомендуется проведение дыхательного теста, как безболезненного, не инвазивного и высокоинформативного метода.

Как лечить хеликобактер пилори?

Диагностикой и лечением этой инфекции занимается врач-гастроэнтеролог. Перед началом лечения рекомендуется сдать анализы на хеликобактер пилори. Выявление инфекции Helicobacter pylori в отсутствие воспалительных заболеваний желудочно-кишечного тракта является показанием к лечению.

Для лечения хеликобактерной инфекции разработано несколько терапевтических схем, включающих один, два или три антибактериальных препарата, антисекреторные средства  и препараты висмута.

Контроль за эрадикацией (уничтожением) Helicobacter pylori осуществляют через 2-6 недель после проведенного лечения как минимум двумя методами диагностики из приведенных выше.

Вам также может быть интересно:

Гастродуоденит

Гастроскопия

Риск возникновения рака желудка

Автор: Мамунц Цовинар Алексеевна

Главный врач Президент-Мед г. Видное

Высшее медицинское, Пермский государственный медицинский институт, лечебный факультет, специальность-лечебное дело

Записаться к врачу

ОТЗЫВЫ КЛИЕНТОВ

наталья

Долго собиралась с духом на проведение процедуры гастроскопии и, как оказалось, совершенно зря. При первом общении с доктором сразу попадаешь в атмосферу спокойствия и доброжелательности. это достаточно неприятное исследование Владимир Израилевич сделал очень нежно и безболезненно. Огромное ему спасибо. Руки у него просто золотые. Теперь на контрольную гастроскопию через 6…[…]

Лечение хеликобактерной инфекции (Helicobacter pylori), симптомы, осложнения

Helicobacter Pilory (Хеликобактер пилори) —  бактерия, которая может жить длительное время, иногда в течении всей жизни человека, в слизистой оболочке желудка и двенадцатиперстной кишки и вызывать ее воспаление. На фоне этого воспаления снижается «устойчивость» оболочки желудочно-кишечного тракта к агрессивным факторам внутренней среды. Распространяясь с течением времени из антрального отдела в тело желудка, инфекция приводит к развитию пангастрита, который по мере прогрессирования заболевания может привести к атрофии слизистой,  кишечной метаплазии и раку желудка.

Основные симптомы

Присутствие Хеликобактер пилори в организме человека часто не проявляется в виде каких-либо симптомов, пока у него не разовьется гастрит или язва желудка или двенадцатиперстной кишки.

Симптомы активного гастрита, вызванного инфекцией Helicobacter Pilory

• голодные боли в эпигастрии;
• повышенный аппетит
• изжога, отрыжка кислым;
• тошнота, рвота, приносящая облегчение
• склонность к запорам.

Механизм развития заболеваний, вызываемых бактерией H.pilory

Важным механизмом, защищающим H. pylori от воздействия агрессивной среды желудочного сока, является способность продуцировать агрессивно влияющие на слизистую ферменты (уреазу) и токсины. Эти ферменты способствуют понижению кислотности желудочного сока, а также повреждают защитный слизистый слой желудка, оголяют поверхностные клетки слизистой (эпителиоциты), делая их уязвимыми для соляной кислоты и пепсина. Колонизировав слизистую оболочку желудка, H. pylori вызывает ее воспаление, язвы, атрофию. Согласно современным представлениям атрофия слизистой оболочки желудка – это уменьшение количества желез, характерных для слизистой оболочки данного отдела желудка, и появление в железах клеток, которые не свойственны данному отделу желудка (метаплазия).

Когда необходимо обратиться к врачу

• дискомфорт и боли в эпигастрии, под ложечкой;
• тяжесть после после еды;
• жалобы на запах изо рта;
• рецидивирующий кариес;
• изжога, отрыжка кислым;
• нарушения стула;
• тошнота или рвота.

Осложнения

Заражение Хеликобактер пилори может вызывать острые и хронические заболевания: нейтрофильный острый гастрит, хронический активный гастрит, атрофический гастрит, язвенную болезнь, кишечную метаплазию эпителия желудка (замещение клеток желудка клетками кишечника), рак желудка, мальтому желудка, b-клеточную неходжкинскую лимфому желудка.

Вред, который бактерия Хеликобактер пилори нанесет желудку, зависит не только от состояния иммунной системы человека, но и от того, каким именно штаммом бактерии произошло заражение. Разные штаммы бактерии вырабатывают разный состав токсинов, повреждающих слизистую оболочку. Не у всех людей заражение этой бактерией приводит к развитию заболеваний желудка и двенадцатиперстной кишки, но если такие заболевания есть, уничтожение бактерии обеспечит заболевшим в большинстве случаев полное выздоровление.

Бактериальная инфекция H. pylori: симптомы, диагностика, лечение, профилактика

Helicobacter pylori ( H. pylori ) — это тип бактерий. Эти микробы могут проникнуть в ваше тело и жить в пищеварительном тракте. Спустя много лет они могут вызвать язвы, называемые язвами, на слизистой оболочке желудка или в верхней части тонкой кишки. У некоторых людей инфекция может привести к раку желудка.

Заражение H. pylori является обычным явлением. Около двух третей населения мира находится в организме.У большинства людей он не вызывает язвы или каких-либо других симптомов. Если у вас есть проблемы, существуют лекарства, которые могут убить микробы и помочь заживлению ран.

По мере того, как все больше людей в мире получает доступ к чистой воде и санитарии, все меньше людей заражаются бактериями . Имея хорошие привычки в отношении здоровья, вы можете защитить себя и своих детей от H. pylori .

Как H. pylori вызывает болезнь

На протяжении десятилетий врачи считали, что язвы у людей возникают в результате стресса, острой пищи, курения или других привычек образа жизни.Но когда в 1982 году ученые обнаружили H. pylori , они обнаружили, что микробы были причиной большинства язв желудка .

Продолжение

После того, как H. pylori попадает в ваше тело, он атакует слизистую оболочку желудка, которая обычно защищает вас от кислоты, которую ваше тело использует для переваривания пищи. Как только бактерии нанесут достаточно вреда, кислота может проникнуть через слизистую оболочку, что приведет к язвам. Они могут кровоточить, вызывать инфекции или препятствовать прохождению пищи через пищеварительный тракт.

Вы можете получить H. pylori из пищи, воды или посуды. Это чаще встречается в странах или сообществах, где отсутствует чистая вода или хорошая канализация. Вы также можете заразить бактерии при контакте со слюной или другими биологическими жидкостями инфицированных людей.

Многие люди заражаются H. pylori в детстве, но могут заразиться и взрослые. Микробы живут в организме годами до появления симптомов, но у большинства людей язвы никогда не появятся. Врачи не знают, почему только у некоторых людей появляются язвы после инфекции.

Симптомы

Если у вас язва, вы можете почувствовать тупую или жгучую боль в животе. Это может приходить и уходить, но вы, вероятно, почувствуете это больше всего, когда у вас пустой желудок, например, между приемами пищи или посреди ночи. Это может длиться от нескольких минут до нескольких часов. Вы можете почувствовать себя лучше после еды, питья молока или приема антацидов.

Продолжение

К другим признакам язвы относятся:

Язвы могут кровоточить в желудок или кишечник, что может быть опасно для вашего здоровья.Немедленно обратитесь за медицинской помощью, если у вас есть какие-либо из этих симптомов:

Это нечасто, но инфекция H. pylori может вызвать рак желудка. Поначалу болезнь имеет несколько симптомов, например изжогу. Со временем вы можете заметить:

• Боль или опухоль в животе
• Тошнота
• Отсутствие голода
• Чувство сытости после небольшого количества еды
• Рвота
• Беспричинная потеря веса

Диагноз

Если у вас нет симптомов язвы, врач, вероятно, не проверит вас на H.pylori . Но если они у вас есть сейчас или были в прошлом, лучше пройти тестирование. Лекарства, такие как нестероидные противовоспалительные препараты (НПВП), также могут повредить слизистую оболочку желудка, поэтому важно выяснить, что вызывает ваши симптомы, чтобы вы могли получить правильное лечение.

Продолжение

Для начала ваш врач спросит вас о вашей истории болезни, симптомах и лекарствах, которые вы принимаете. Затем вам проведут медицинский осмотр, в том числе надавят на живот, чтобы проверить, нет ли отека, болезненности или боли.Вы также можете иметь:

• Анализы крови и стула, , которые могут помочь найти инфекцию.
• Дыхательный тест на мочевину. Вы выпьете особую жидкость, которая содержит вещество, называемое мочевиной. Затем вы вдохнете в сумку, которую врач отправит в лабораторию для тестирования. Если у вас H. pylori , бактерии превратят мочевину в вашем организме в углекислый газ, а лабораторные тесты покажут, что в вашем дыхании уровень газа выше нормы.

Чтобы более внимательно изучить ваши язвы, ваш врач может использовать:

• Эндоскопия верхних отделов желудочно-кишечного тракта. В больнице врач с помощью трубки с маленькой камерой, называемой эндоскопом, будет смотреть вниз по горлу, в желудок и верхнюю часть тонкой кишки. Эту процедуру также можно использовать для сбора образца, который будет исследован на наличие бактерий. Вы можете спать или бодрствовать во время процедуры, но вы получите лекарство, чтобы вам было комфортнее.
• Тесты верхнего GI . В больнице вы выпьете жидкость, содержащую вещество, называемое барием, и ваш врач сделает вам рентгеновский снимок.Жидкость покрывает ваше горло и желудок, выделяя их на изображении.
• Компьютерная томография (КТ). Это мощный рентгеновский снимок, позволяющий детально снимать внутреннюю часть вашего тела.

Если у вас H. pylori , ваш врач может также проверить вас на рак желудка. Сюда входят:

• Физический осмотр
• Анализы крови для проверки на анемию, когда в вашем организме недостаточно эритроцитов. Это может произойти, если у вас кровоточащая опухоль.
• Анализ кала на скрытую кровь, который проверяет ваш стул на наличие крови, невидимой невооруженным глазом.
• Эндоскопия
• Биопсия, когда врач берет небольшой кусочек ткани вашего желудка, чтобы найти признаки рака. Ваш врач может сделать это во время эндоскопии.
• Тесты, которые делают подробные снимки внутренних органов вашего тела, такие как компьютерная томография или магнитно-резонансная томография (МРТ)

Лечение H. pylori

Если у вас есть язвы, вызванные H.pylori , вам понадобится лечение, чтобы убить микробы, вылечить слизистую оболочку желудка и предотвратить повторное появление язв . Обычно для выздоровления требуется 1-2 недели лечения.

Ваш врач, вероятно, посоветует вам принимать несколько различных типов лекарств. Возможные варианты:

• Антибиотики для уничтожения бактерий в организме, такие как амоксициллин, кларитромицин (биаксин), метронидазол (флагил), тетрациклин (сумицин) или тинидазол (тиндамакс). Скорее всего, вы возьмете как минимум двоих из этой группы.
• Лекарства, снижающие количество кислоты в желудке, блокируя крошечные насосы, которые ее производят. К ним относятся декслансопразол (Dexilant), эзомепразол (Nexium), лансопразол (Prevacid), омепразол (Prilosec), пантопразол (Protonix) или рабепразол (Aciphex).
• Субсалицилат висмута, который также может помочь убить H. pylori вместе с вашими антибиотиками.
• Лекарства, блокирующие химический гистамин, который заставляет ваш желудок вырабатывать больше кислоты. Это циметидин (Тагамет), фамотидин (Флюксид, Пепцид), низатидин (Аксид) или ранитидин (Зантак).

Ваше лечение может означать, что вы будете принимать 14 или более таблеток в день в течение нескольких недель, что кажется большим количеством лекарства. Но действительно важно принимать все, что прописывает врач, и следовать его инструкциям. Если вы не принимаете антибиотики правильно, бактерии в вашем организме могут стать к ним устойчивыми, что затрудняет лечение инфекций. Если ваши лекарства беспокоят вас, поговорите со своим врачом о вариантах лечения и о том, как вы можете справиться с побочными эффектами.

Примерно через 1-2 недели после окончания лечения врач может снова проверить ваше дыхание или стул, чтобы убедиться, что инфекция исчезла.

Профилактика

Вы можете защитить себя от заражения H. pylori , выполнив те же действия, что и другие микробы:

• Мойте руки после посещения туалета, а также перед приготовлением или приемом пищи. Учите детей делать то же самое.
• Избегайте нечистой пищи и воды.
• Не ешьте плохо приготовленные продукты.
• Избегайте еды, которую подают люди, которые не мыли руки.

Хотя стресс и острая пища не вызывают язв, они могут помешать их быстрому заживлению или усугубить боль.Поговорите со своим врачом о том, как справиться со стрессом, улучшить диету и, если вы курите, как вам помочь бросить курить.

Чего мне ожидать после инфицирования H. pylori?

Большинство язв, вызванных H. pylori , заживают через несколько недель лечения. Если вы принимали один из них, вам следует избегать приема НПВП от боли, поскольку эти препараты могут повредить слизистую оболочку желудка. Если вам нужно обезболивающее, попросите врача порекомендовать его.

Где я могу найти информацию или поддержку?

Вы можете найти информацию о H.pylori и язвы от Американского колледжа гастроэнтерологии. Чтобы получить информацию о раке желудка, а также о группах поддержки в Интернете и на местном уровне, посетите Американское онкологическое общество.

Что такое H. pylori? Симптомы, причины, диагностика, лечение и профилактика

Рекомендуется посещать врача каждый раз, когда у вас возникают необычные боли в животе или жалобы, особенно если они постоянные или повторяющиеся.

Немедленно обратитесь к врачу, если у вас возникнут следующие симптомы:

• Сильная боль в животе или другая боль в животе
• Не проходит боль в животе или животе
• Затруднение при глотании
• Кровавый, черный или дегтеобразный стул
• Кровавая рвота или рвота, похожая на кофейную гущу

Существуют разные способы проверки на H.pylori .

Сначала ваш врач, вероятно, проведет медицинский осмотр и спросит о вашей истории болезни. Затем они могут порекомендовать один или несколько из этих тестов для выявления бактерий.

Анализ крови Анализ крови может быть проведен для поиска антител H. pylori в вашем организме. Хотя анализы крови выполнить легко, они часто не так точны, как другие диагностические подходы.

Дыхательный тест Дыхательный тест заключается в проглатывании таблетки, жидкости или пудинга, содержащих углерод.Если у вас инфекция H. pylori , ваш врач сможет обнаружить молекулы углерода, когда вы выдыхаете в мешок.

Детям младшего возраста часто бывает трудно провести дыхательные тесты, и вы не можете принимать определенные лекарства, такие как ингибиторы протонной помпы, антибиотики или пепто-бисмол (субсалицилат висмута), в течение недели или двух до сдачи теста. .

Анализ стула Образец стула может помочь врачам обнаружить белки, которые связаны с H. pylori .Перед прохождением этого теста вам необходимо прекратить прием таких лекарств, как ингибиторы протонной помпы, антибиотики или субсалицилат висмута.

Верхняя эндоскопия

Во время верхней эндоскопии ваш врач сначала даст вам легкое успокаивающее средство, а затем проведет длинную трубку с крошечной камерой на конце вниз по горлу, мимо пищевода и в желудок. Это позволит вашему врачу заглянуть внутрь вашего пищеварительного тракта и при необходимости удалить небольшие кусочки ткани (известные как образцы биопсии).

Если образцы ткани удалены, их можно проанализировать на инфекцию H. pylori . Эндоскопия считается более инвазивной, чем другие методы, такие как анализ кала или дыхательный тест.

Следует ли вам проходить обследование на H. pylori?

В местах, где высок риск заражения H. pylori , врачи проверяют здоровых людей на наличие бактерий, даже если у них нет признаков или симптомов, что называется медицинским обследованием. Но в медицинском сообществе ведутся споры о том, полезна ли такая степень скрининга.

Было бы неплохо пройти тест на H. pylori , если у вас высокий риск рака желудка.

Прогноз H. pylori

Многие люди с H. pylori не испытывают никаких симптомов болезни и даже не подозревают, что у них инфекция.

Если у вас действительно есть симптомы или развиваются осложнения, лечение обычно бывает успешным. Инфекция H. pylori часто можно вылечить с помощью лечения, состоящего из антибиотиков и препаратов, снижающих кислотность.

Коллекция бактериального генома и культур кишечника человека для улучшенного метагеномного анализа

Сборка коллекции культур желудочно-кишечных бактерий

Чтобы собрать полную коллекцию бактериальных изолятов из желудочно-кишечного тракта человека, мы культивировали и очищали бактериальные изоляты из образцов фекалий 20 человек. взрослые, проживающие в Соединенном Королевстве ( n = 8) и Северной Америке ( n = 12). Всего было отобрано более 10 000 бактериальных изолятов, которые затем были классифицированы таксономически с использованием секвенирования генов 16 S рРНК.В сочетании с 234 изолятами желудочно-кишечного тракта, о которых мы ранее сообщали, ^{, 17,} , 737 очищенных и заархивированных изолятов теперь включены в HBC. В этой коллекции представлены 273 вида (105 новых видов) из 31 семейства в типе Actinobacteria (53 генома; 16 видов), Bacteroidetes (143 генома; 40 видов), Firmicutes (496 геномов; 203 вида) и Proteobacteria (45 геномов; 14 видов). ) (Дополнительная таблица 1). Последовательность генома доступна для каждого изолята в HBC.

Мы объединили наши геномы HBC с 617 общедоступными высококачественными геномами желудочно-кишечных бактерий человека, доступными через базу данных генома Национального центра биотехнологической информации (NCBI), чтобы создать Коллекцию генома желудочно-кишечной микробиоты человека (HGG; дополнительная таблица 1).Примечательно, что 53% видов, представленных в геномах HGG, заархивированы в HBC. Многие из оставшихся видов, которые в настоящее время отсутствуют в HBC, но присутствуют в HGG, включают представителей Fusobacteria, Proteobacteria и Synergistetes, которые обычно отсутствуют у здоровых людей в развитом мире. Это говорит о том, что требуется дальнейшее целевое культивирование от более разнообразной когорты здоровых доноров и тех, кто страдает заболеванием, для исчерпывающего архивирования бактериального компонента микробиоты желудочно-кишечного тракта человека.

В общей сложности 1354 генома в HGG представляют 530 видов из 57 семейств в пределах филы Actinobacteria (129 геномов; 55 видов), Bacteroidetes (231 геном; 69 видов), Firmicutes (772 генома; 339 видов), Fusobacteria (26 геномы; 9 видов), Proteobacteria (194 генома; 56 видов) и Synergistetes (2 генома; 2 вида) (дополнительный рисунок 1). Чтобы понять филогенетические отношения между этими таксонами, мы извлекли 40 универсальных ядерных генов ²¹ из каждого генома и провели филогенетический анализ (рис.1; Дополнительный рис. 2). В целом максимальное филогенетическое разнообразие наблюдалось у Firmicutes, особенно у классов Clostridia, Erysipelotrichia и Negativicutes; однако широкий спектр видов и филогенетических групп представлен во всех типах (рис. 1; дополнительный рис. 2).

Рис. 1: Филогенетическое разнообразие коллекции генома желудочно-кишечной микробиоты человека.

Дерево максимального правдоподобия, созданное с использованием 40 универсальных основных генов из 737 геномов HBC (зеленый внешний круг) и 617 высококачественных общедоступных геномов, полученных из образцов желудочно-кишечного тракта человека, которые вместе составляют HGG.Цвет ветвей различает бактериальные типы, принадлежащие Actinobacteria (золотой; n = 129 геномов), Bacteroidetes (зеленый; n = 231 геном), Firmicutes (синий; n = 772 генома), Fusobacteria (черный; n ). = 26 геномов), Synergistetes (розовый; n = 2 генома) и Proteobacteria (оранжевый; n = 194 генома).

HGG улучшает анализ метагеномов желудочно-кишечного тракта

В отсутствие эталонных геномов современный анализ метагеномного секвенирования зависит от сборки необработанных считываний de novo с последующим объединением контигов для создания геномных последовательностей, собранных в метагеноме (MAGs). ).Чтобы сравнить эффективность таксономической классификации сборки de novo и биннинга с анализом RBMA, мы рассмотрели 13 490 общедоступных (дополнительная таблица 2) метагеномов дробовика из фекалий с достаточным охватом чтения для выполнения сборки de novo. Сборка de novo и биннинг контигов выявили 11 892 образца (88,2%), которые были достаточного качества для получения контигов длиной более или равной 2 000 пар оснований (п.н.). Всего из 9548 сборок было получено 39 913 бункеров с полнотой> 90% и загрязнением <5%, далее именуемые MAG (дополнительная таблица 3).Из этих MAG 81% имели по крайней мере 15 тРНК, что еще раз подчеркивает их высокий уровень полноты; однако только 16,1% (межквартильный размах, IQR = 31,2–8,2%) оснований чтения вносили вклад в эти MAG (рис. 2a).

Рис. 2: Сравнение высококачественных эталонных геномов от сборки de novo и HGG.

a , Использование баз чтения в процентах от общего количества баз чтения, присутствующих в образцах метагеномики ( n = 13 490), которые могут быть сопоставлены с их соответствующими de novo собранными контигами (мин., 22,23; Q1: 62,87; медиана 76,89; Q3, 89,99; макс., 99,98) и геномов, собранных в метагеномах (MAGs; мин. 0,16; Q1, 8,17; медиана, 16,09; Q3, 31,16; макс., 65,64). b , Общее количество классифицированных бункеров с использованием HGG (синий), геномов, полученных только из коллекции HBC (HBC; оранжевый), HMP (фиолетовый) и изолятов, полученных из желудочно-кишечного тракта из HMP (HMP-GI; зеленый). c , общее количество 39 913 MAG, классифицированных с использованием подвыборочных наборов геномов из HGG (синий), HBC (оранжевый), HMP (фиолетовый) и HMP-GI (зеленый).Планки погрешностей показывают среднее и стандартное отклонение. ( n = 100 бутстрапов).

Чтобы оценить, как только коллекция генома HBC и полная коллекция HGG сравнивается с существующими геномами HMP, мы затем рассмотрели, какие из MAG можно идентифицировать, используя каждую коллекцию в качестве справочной базы данных. HGG смог идентифицировать 25 085 MAG по сравнению с 20 772 геномами, соответствующими только HBC. Между тем, 16 476 MAG были идентифицированы с помощью коллекции HMP из всех 18 участков тела, и 15 156 MAG были обнаружены при включении только изолятов HMP из участков желудочно-кишечного тракта (HMP-GI).Это представляет собой улучшение на 52,3% при использовании коллекции HGG в качестве эталона по сравнению с полным HMP (рис. 2b). Поскольку коллекция HGG значительно больше, чем коллекции геномов HBC, HMP и HMP-GI, мы затем выполнили загрузочную подвыборку каждой базы данных генома и сравнили выбранные геномы с ранее идентифицированными MAG по средней идентичности нуклеотидов (ANI> 95%). Учитывая подвыборки из 400 геномов, последнюю точку данных, доступную для HMP-GI, HGG достигает 19 545 совпадений, а коллекция геномов HBC — 19036 совпадений по сравнению с 14 906 совпадениями с HMP-GI и 9 655 совпадениями с полным HMP (рис.2в). Полная классификация затруднена, так как включает геномы негастроинтестинальных видов. Примечательно, что большее соответствие, достигнутое с использованием геномов HGG и HBC, предполагает, что в этих наборах данных также присутствует более репрезентативное филогенетическое разнообразие. Таким образом, наш анализ демонстрирует увеличение классификационного потенциала HGG на 61,1% по сравнению с существующими геномами.

Основанная на филогении оценка покрытия генома в метагеномах

Хотя возможно генерировать MAGs с использованием подходов сборки de novo и биннинга, этот метод по-прежнему не может присвоить 83.9% считываний учитывались в 13 490 образцах с метагеномной последовательностью, проанализированных в этом исследовании. Чтобы устранить это ограничение, мы затем сравнили все собранные de novo контиги с HGG, чтобы определить возможность классификации большей части входных данных. Применяя этот метод, мы смогли сопоставить 74,5% (IQR = 84,1% –62,9%) контигов на уровне, примерно эквивалентном роду (отсечение 90%), тогда как мы могли назначить 67,3% (IQR = 78,7% –54,8%) на уровне видов (отсечение 95%; рис. 3а). Примечательно, что 40.8% (54,3–30,0%) могут быть отнесены к уровню ниже уровня вида (отсечение 99%), несмотря на то, что в HGG не включены какие-либо изоляты, культивируемые из любого из этих образцов (рис. 3a).

Рис. 3: Эффективность классификации с использованием HGG.

a , Отнесение контигов к 13 490 метагеномным образцам по роду (90%; мин. 31,35; Q1, 62,92; медиана, 74,48; Q3, 84,10; макс., 100,0), виды (95%; мин. 18,94) ; Q1, 54,80; медиана, 67,35; Q3, 78,73; макс., 100,0) и деформация (99%; минимум, 0,0; Q1, 30,03; медиана, 40.82; Q3, 54,35; макс., 90,77) идентичности по сравнению с HGG. b , Классификация метагеномных секвенированных образцов из Северной Америки ( n = 2064; мин. 1,31; 1 квартал 79,07; медиана 88,16; 3 квартал 98,42; макс. 99,97), Европы ( n = 1431; мин., 52,07; Q1, 76,28; медиана, 80,66; Q3, 84,47; макс., 99,52), Азия ( n = 191; минимум, 72,37; Q1, 86,56; медиана, 90,84; Q3, 94,13; макс. , 98.93) и другие неопределенные местоположения ( n = 9804; мин. 1,45; Q1 76,28; медиана 82.14; Q3, 88,25; макс., 99,94).

Учитывая улучшения в классификации, которые обеспечивает HGG, мы затем приняли RBMA с наименьшим общим предком, чтобы определить общую эффективность таксономической классификации для того же набора данных. По сравнению с подходами метагеномной сборки и биннинга de novo, RBMA более устойчив к низкому охвату выборкой, поскольку требует меньшей глубины секвенирования для уверенного присвоения последовательности эталонному геному. С этими наборами данных для RBMA крупномасштабных наборов метагеномных данных требуется среднее время обработки 7.3 мин для каждого образца по сравнению с 12,19 ч, необходимыми для эквивалентной сборки de novo. Это существенное снижение требуемой вычислительной производительности дает возможность обрабатывать больше образцов и преодолевать ограничения статистической мощности, мешающие многим метагеномным исследованиям.

Горизонтальный перенос генов мобильных элементов в бактериальных популяциях и сообществах может ограничить нашу способность идентифицировать истинный видовой состав из-за неправильного чтения. Чтобы устранить мешающие факторы, связанные с горизонтальным переносом генов, и обеспечить более точную оценку таксономического охвата, мы также создали исчерпывающий список мобильных элементов, последовательностей вставок и плазмид, найденных в Европейском нуклеотидном архиве (ENA) ²² .В сочетании с мобильными элементами, предсказанными в HGG, это представляет собой обширную базу данных известных мобильных элементов, обнаруженных в желудочно-кишечной микробиоте человека. База данных включает 2803 плазмиды и 489 транспозонов и инсерционных последовательностей, которые были замаскированы в геномах и отфильтрованы из метагеномных считываний перед классификацией наименьшего общего предка, чтобы максимизировать филогенетический сигнал (дополнительная таблица 4). Когда мы применили RBMA с самым низким общим предком с HGG, отфильтрованным мобильным элементом, классификация необработанных считываний достигла среднего таксономического назначения 82.9% на уровне родов и 78,7% на уровне видов. Взятые вместе, эти анализы показывают, что классификация с высоким разрешением большинства метагеномных считываний, полученных из микробиоты желудочно-кишечного тракта человека, может быть достигнута с помощью HGG даже при рассмотрении образцов из разных географических популяций (рис. 3b).

Бактериальное разнообразие в желудочно-кишечном тракте человека

Далее мы попытались понять, какие виды были наиболее распространены в желудочно-кишечной микробиоте человека, используя HGG.Для этого мы опросили все 13 940 высококачественных метагеномных образцов ружья, полученных из человеческих фекалий (дополнительная таблица 2). Хотя на этот анализ могут повлиять различия в условиях хранения образцов фекалий и методы выделения ДНК ²³ , мы пришли к выводу, что те виды, которые широко распространены в образцах от многих людей, вероятно, будут играть важную роль в биологии человека и должны быть в центре внимания. дальнейшего расследования. Принимая во внимание только виды, которые присутствуют на уровне выше 0.01% в пределах любой выборки, мы идентифицировали 165 видов, присутствующих в более чем двух несвязанных выборках (дополнительная таблица 5). В эту группу доминирующих видов вошли Bacteroidetes ( n = 41), Firmicutes ( n = 82), Proteobacteria ( n = 27) и Actinobacteria ( n = 15). Учитывая фоновую распространенность каждого типа, это представляет собой значительную чрезмерную представленность видов из Bacteroidetes ( P <0,05) и значительную недопредставленность видов из Firmicutes ( P <0.01).

Учитывая все виды, которые были обнаружены выше фонового уровня, большинство доминирующих видов остаются членами Bacteroidetes. В общей сложности 8 из 20 наиболее распространенных видов принадлежали к роду Bacteroides ( Bacteroides vulgatus , Bacteroides uniformis , Bacteroides cellulosilyticus , Bacteroides ovatus 9000anolowides, Bacteroides caccae и Bacteroides dorei ).С поправкой на количество видов в каждой филогенетической группе, Bacteroidetes в целом и родов Bacteroides и Parabacteroides ( Parabacteroides distasonis и Parabacteroides merdae ), в частности, значительно перепредставлены ( P ); Рис.4). Несмотря на то, что три из них представляют собой более 346 видов в пределах Firmicutes, существует только 6 отдаленно связанных видов Firmicute, которые широко представлены у многих особей ( Fecalibacterium prausnitzii , Blautia obeum , Fusicatenibacter saccharivorans , Anaerostipes 000300030003000300030004 и Dorea longicatena ; рис.4). В целом, все обнаруженные роды в пределах филума Firmicutes были статистически недопредставлены по своей встречаемости. Точно так же единственным представителем Proteobacteria, который был широко распространен в образцах, был Escherichia coli , при этом большинство Proteobacteria не было обнаружено в образцах. Интересно, что ни один из представителей Fusobacteria или Synergistetes не оказался преобладающим на рассматриваемом уровне обнаружения, что позволяет предположить, что они обнаруживаются только при определенных условиях или этапах жизни, которые не были включены в этот анализ.

Рис. 4: Доминирующие виды бактерий в кишечной микробиоте человека.

Доминирующие виды, упорядоченные по распространенности, обнаруженные в 13 490 метагеномных образцах желудочно-кишечного тракта человека, и их относительная численность в каждом образце. Цвет обозначает Bacteroidetes (зеленый), Firmicutes (синий), Proteobacteria (оранжевый), Actinobacteria (золотой).

Эти данные предполагают потенциальную ключевую роль определенных членов Bacteroides в желудочно-кишечном тракте человека.Напротив, значительно большее разнообразие, наблюдаемое у Firmicutes, другого доминирующего типа, предполагает наличие сильно изменчивой, потенциально функционально избыточной группы, что согласуется с предыдущими сообщениями о динамической спорово-опосредованной передаче и обороте для многих таксонов в этой группе ^17,24 . Хотя лабораторный фенотипический анализ, изучающий многие ключевые виды, которые были идентифицированы в ходе этого исследования, остается ограниченным, теперь с этим можно справиться путем доступа к изолятам, заархивированным в HBC.

Учитывая разнообразие новых геномов, содержащихся в HGG, мы затем попытались понять распространенность этих видов в сообществе. Важно отметить, что наличие этих геномов позволяет нам впервые достоверно оценить распространенность этих видов в образцах метагенома. В общей сложности 106 из 173 новых геномов (60,9%) обнаружены с изобилием более 0,001% по крайней мере в одном образце из 13 490 доступных общедоступных образцов метагенома. Примечательно, что почти половина (87; 48.6%) были обнаружены в> 100 образцах, но менее четверти (39; 21,8%) были обнаружены в> 1000 образцах. Интересно, что три новых вида в составе Clostridiales были обнаружены почти в половине проанализированных образцов. Два новых вида Lachnospiraceae были обнаружены соответственно в 7 797 (55,9%) и 7 074 (50,7%) образцах, а новый вид Ruminococcaceae был обнаружен в 6 777 (48,6%) образцах. В совокупности эти данные позволяют предположить, что многие из новых видов и геномов, идентифицированных в ходе этой работы, часто встречаются в человеческой популяции и потенциально представляют собой неотъемлемые части желудочно-кишечной микробиоты человека, которые требуют дальнейшего исследования.

Функции желудочно-кишечных бактерий человека

Эта расширенная коллекция бактериальных изолятов с секвенированием генома позволяет проводить функциональный и таксономический анализ с высоким разрешением. Сначала мы выполнили кластеры аннотации ортологичной группы белков (COG) ²⁵ в белковых последовательностях, чтобы определить те особенности, которые преобладают у бактерий HGG. Этот анализ выявил 4696 различных ортологичных групп, представленных по крайней мере в одном изоляте. Как и ожидалось, домашние функции бактерий, включая функцию рибосомного белка, синтез аминокислот и другие функции, связанные с трансляцией, доминируют над 30 функциями, обнаруженными у всех бактерий в коллекции (дополнительная таблица 6).

Чтобы понять различия в функциональной роли, выполняемой представителями четырех основных бактериальных типов микробиоты желудочно-кишечного тракта (Bacteroidetes, Firmicutes, Actinobacteria и Proteobacteria), мы сравнили 4696 ортологичных групп, идентифицированных с помощью анализа COG с использованием дискриминантного анализа основных компонентов (DAPC). . Это сравнение демонстрирует четкие функциональные различия между ключевыми типами микробиоты желудочно-кишечного тракта человека (рис. 5). Затем мы провели дополнительный анализ, чтобы определить те функции, которые чрезмерно представлены в каждом типе, по сравнению со всеми функциями, присутствующими в HGG.Этот анализ выявил 8, 122, 152 и 389 статистически обогащенных функций ( q <0,001) у Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes и Proteobacteria, соответственно (дополнительная таблица 7). Обогащенные функции актинобактерий были ограничены, но идентифицированные в основном были связаны с липидами ( q <1,99 × 10 ⁻⁸³ ) и углеводным обменом ( q <7,57 × 10 ⁻⁷⁷ ). Эквивалентный анализ специфических функций Bacteroidetes выявил многие ключевые функции, включая железо ( q <1.18 × 10 ⁻¹¹⁴ ) и функции переносчика серы ( q <6,82 × 10 ⁻⁹⁷ ) и специфических транспортирующих натрий НАДН убихинон оксидоредуктазы ( q <3,47 × 10 ⁻¹²⁴ ). В фирмах преобладали нехарактеризованные функции; однако образование спор ( q <3,48 × 10 ⁻¹²³ ) и транспорт тиамина ( q <2,76 × 10 ⁻¹⁰¹ ) и рибофлавина ( q <7,04 × 10 ⁻¹⁰¹ ) были полностью высокообогащенный.Наконец, среди Proteobacteria преобладали фруктозобисфосфатаза ( q <4,50 × 10 ^-140 ), глюкокиназы ( q <4,55 × 10 ^-125 ) и регуляторы образования кластеров железа ( q <9,20 × 10 ⁻⁹⁸ ). Эти результаты демонстрируют явные различия в уникальных функциях, обеспечиваемых ключевыми типами желудочно-кишечной микробиоты человека; однако преобладание нехарактеризованных функций дополнительно демонстрирует потребность в улучшении аннотации генома и функциональной геномики для понимания этих бактерий.

Рис. 5: Бактериальные функции в желудочно-кишечном тракте человека.

DAPC-анализ функциональных категорий показывает четкое разделение функций, связанных с каждым доминирующим типом (Bacteroidetes (зеленый; n = 231 геном), Firmicutes (синий; 772 генома), Proteobacteria (оранжевый; n = 194 генома)) , Актинобактерии (золото; n = 129 геномов)) в коллекции HGG.

Коллекция HGG содержит геномы 173 видов, ранее не выделенных из желудочно-кишечного тракта человека.Сюда входят геномы 105 новых видов в HBC и геномы 68 известных видов, у которых секвенированные геномом изоляты из желудочно-кишечного тракта человека ранее не существовали (дополнительная таблица 1). Чтобы понять, какие функции были обнаружены у этих 173 видов, но отсутствовали у ранее описанных геномно-секвенированных видов, мы провели функциональный анализ. Всего было выявлено 45 вновь описанных функций, из которых 41 была найдена в Firmicutes. Хотя в этих функциях преобладали не охарактеризованные белки, новые функции включали функции, связанные с тетрагидрометаноптерином S -метилтрансферазой (присутствует у пяти видов), препротеин-транслоказой (также присутствует у пяти видов) и ферментом, активирующим формальдегид, необходимым для метаногенеза (обнаруженным в четырех из них). ранее не охарактеризованные Фирмикуты).Кроме того, предполагается, что 83,2% этих вновь секвенированных изолятов и 85,8% новых видов образуют споры на основе ранее определенных геномных сигнатур ¹⁷ .

Наконец, мы стремились понять, какие функции, как было предсказано, должны иметь место у недавно секвенированных геномов членов определенного типа, но отсутствовали во всех существующих геномах этого типа. Этот анализ идентифицировал компоненты системы секреции типа III, IV и VI у Bacteroidetes, которые не были обнаружены ни в одном из ранее секвенированных желудочно-кишечных Bacteroidetes, но были распознаны в существующих геномах Proteobacteria и Firmicutes.Точно так же функции переносчика ABC, обнаруженные в существующих геномах Proteobacteria, были идентифицированы в недавно секвенированных желудочно-кишечных Firmicutes, но не в каком-либо из ранее секвенированных изолятов. Это предполагает дальнейшее функциональное перекрытие, которое может существовать между конкретными членами филюмов с потенциально важными, избыточными ролями в динамике микробного сообщества и взаимодействиях хозяин-микробиота.

Есть ли связь между инфекциями крови и колоректальным раком?

Новое исследование обнаружило связь между инфекциями крови, вызванными анаэробными бактериями, и колоректальным раком.Это открытие может помочь при будущих обследованиях на рак.

Недавнее исследование показало, что анаэробные бактериальные инфекции крови связаны с повышенным риском развития колоректального рака.

Исследование, которое исследователи представят на Европейском конгрессе клинической микробиологии и инфекционных заболеваний 2020 года, может помочь клиницистам улучшить скрининг колоректального рака.

Колоректальный рак возникает в толстой или прямой кишке. По данным Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC), это третий по распространенности тип рака в США.Около 90% случаев возникает у людей в возрасте 50 лет и старше.

Помимо возраста, к факторам риска относятся семейный анамнез колоректального рака, некоторые генетические синдромы, ожирение, отсутствие физических упражнений, диета с низким содержанием фруктов и овощей и воспалительные заболевания кишечника.

Анаэробным бактериям, в отличие от аэробных, не требуется кислород для функционирования. Это нормальная часть человеческого тела, существующая в различных местах, включая кишечник.

Обычно они не вызывают инфекций, но чаще всего возникают в том месте, где обитают бактерии.

Авторы нового исследования отмечают, что предыдущие исследования связывали определенные типы анаэробных бактерий с колоректальным раком. Исследователи хотели дополнительно изучить эту связь с помощью крупномасштабного исследования.

Исследование проводилось в двух регионах Дании в период с 2007 по 2016 год. В нем приняли участие более 2 миллионов участников.

Для анализа команда собрала данные о 45 760 инфекциях крови, включая информацию о типах патогенов, присутствующих в кровотоке участников.

Затем авторы сравнили эту информацию с данными из Датской базы данных группы рака прямой кишки. В частности, они искали новые случаи колоректального рака, особенно те, которые развились после заражения крови любой из бактерий, уже связанных с колоректальным раком.

Из 45 760 человек с бактериальной инфекцией крови у 492 (1,1%) позже развился колоректальный рак. Из них 241 (0,5%) были в течение первого года после бактериальной инфекции крови.

Исследователи сопоставили каждого из этих людей по возрасту и полу с контрольной группой из пяти человек, у которых не было инфекции крови.

Авторы исследования обнаружили, что анаэробные бактериальные инфекции крови связаны со значительным увеличением риска колоректального рака.

Например, у тех, кто был инфицирован Clostridium septicum , вероятность развития колоректального рака в течение следующего года в 42 раза выше.

Только 0,5% контрольной группы, не имевшей бактериальной инфекции, заболели колоректальным раком по сравнению с 20.8% из тех, кто имел инфекцию C. septicum .

Как заключают авторы исследования в своей статье: «В этом крупномасштабном когортном исследовании было обнаружено, что у [людей] с инфекциями крови, вызванными отдельными анаэробными бактериями, риск развития колоректального рака увеличивался до 42 раз по сравнению с [людьми] с инфекциями крови, вызванными аэробными бактериями, такими как [ Escherichia coli ] или [ Staphylococcus aureus ] или отрицательными контролями ».

«Обнаружение инфекции крови определенными анаэробными бактериями может потенциально привести к рекомендации скрининга на колоректальный рак у отдельных [людей].

Соавтор исследования д-р Ульрик Юстесен из университетской больницы Оденсе в Дании отмечает, что, хотя существует четкая связь между анаэробными бактериальными инфекциями крови и колоректальным раком, неясно, какая между ними существует причинная связь. .

По словам доктора Юстесена: «На данном этапе мы не уверены, являются ли бактерии непосредственной причиной возникновения колоректального рака или же заражение крови этими бактериями вызвано самим раком. Это пример вопроса «Это курица или яйцо?»

Забегая вперед, д-р.Юстесен и его команда хотят получить более подробную информацию о бактериях у людей, больных раком.

Он говорит: «Наше последующее исследование этого исследования будет сосредоточено на конкретных бактериях [больных раком], чтобы увидеть, сможем ли мы определить конкретные характеристики, которые могут быть причастны к развитию рака. Если это так, это может иметь большое значение, когда дело доходит до скрининга и лечения колоректального рака ».

Это может означать, что скрининг на колоректальный рак может быть более эффективным.По словам доктора Юстесена, «Что касается скрининга, если бы мы увидели эти бактерии высокого риска в сочетании с пожилым возрастом, то определенно стоило бы обследовать [человека] на колоректальный рак».

Хотя результаты интересны, это исследование ожидает презентации на научной конференции. Поэтому подробностей о полной методологии и результатах пока нет.

Исследователи еще не написали полную статью, и результаты не прошли экспертную оценку.Из-за этого невозможно полностью изучить результаты.

Устойчивость к антибиотикам вызывает 1 смерть каждые 15 минут в США

13 ноября, 2019

Читать 5 мин.

ДОБАВИТЬ ТЕМУ В ОПОВЕЩЕНИЯ ПО ЭЛЕКТРОННОЙ ПОЧТЕ

Получать электронное письмо, когда новые статьи публикуются на

Укажите свой адрес электронной почты, чтобы получать сообщения о публикации новых статей.Подписаться Нам не удалось обработать ваш запрос. Пожалуйста, повторите попытку позже. Если у вас по-прежнему возникает эта проблема, обратитесь по адресу [email protected].

Вернуться в Healio

Роберт Р. Редфилд

Хилари М. Бэбкок

Согласно недавно обновленным оценкам, опубликованным CDC, более 2.8 миллионов инфекций ежегодно вызываются устойчивыми к антибиотикам патогенами в Соединенных Штатах, что приводит как минимум к 35 000 смертей.

То есть одно заражение каждые 11 секунд и одна смерть каждые 15 минут.

«Мы должны сохранять бдительность», — сказал на пресс-конференции директор CDC Роберт Р. Редфилд, доктор медицины . «Устойчивость к антибиотикам угрожает как здоровью нашей страны, так и нашей глобальной безопасности, и поэтому мы все играем важную роль в ее предотвращении».

Новые номера

На основе нескольких источников данных в отчете «Угрозы устойчивости к антибиотикам в Соединенных Штатах, 2019 г.» были обновлены часто цитируемые оценки, опубликованные CDC в 2013 г., которые недавно подвергались сомнению.

В отчете за 2013 год подсчитано, что лекарственно-устойчивые инфекции вызывают более 2 миллионов заболеваний и не менее 23000 смертей в США каждый год.

«CDC использовал лучшие данные, доступные в то время, но мы знали, что наша оценка, вероятно, была консервативной и недооценивала истинное бремя устойчивости к антибиотикам», — сказал Майкл Крейг, MPP , из подразделения CDC по координации и стратегии устойчивости к антибиотикам. пресс-конференция.

Пересмотр оценок 2013 года с использованием методологии 2019 года, в которую были включены данные из более чем 700 больниц, показал, что лекарственно-устойчивые инфекции фактически вызвали более двух.6 миллионов болезней и 44 000 смертей каждый год, когда был опубликован отчет за 2013 год. Согласно отчету за 2019 год, с 2013 года количество смертей, связанных с устойчивыми к антибиотикам инфекциями, снизилось на 18% в целом и на 30% в больницах.

Общество эпидемиологии здравоохранения Америки заявило, что отчет показывает, что профилактические меры в больницах работают.

«Мы должны продолжать финансировать и поддерживать эффективные программы профилактики инфекций и рационального использования антибиотиков во всех медицинских учреждениях и использовать все имеющиеся у нас инструменты для предотвращения распространения устойчивости к антибиотикам», — сказал президент SHEA Хилари М.Бэбкок, доктор медицины, магистр здравоохранения, , говорится в заявлении.

ПЕРЕРЫВ

Корнелиус (Нил) Дж. Клэнси

Джейсон П. Бернхэм

В отчете также отмечалось бремя инфекций Clostridioides difficile (CDI), потому что, хотя патоген не является «обычно резистентным», CDI вызывается использованием антибиотиков и распространением бактерий, которые также являются факторами, способствующими развитию резистентности. При включении С.difficile , бремя превысило 3 миллиона инфекций и 48 000 смертей.

«Отчет представляет собой крупную общественную услугу, предоставленную CDC, которая содержит как строгое предупреждение — устойчивость к антибиотикам в США продолжает расти, в том числе среди людей с хорошим здоровьем, которые не находятся в больницах, так и некоторую поддержку — даже в виде цифр. резистентных инфекций увеличилось, процент пациентов, умерших в результате этих инфекций, снизился », Корнелиус (Нил) Дж.Клэнси, доктор медицины , адъюнкт-профессор медицины и директор лаборатории устойчивых к лекарствам патогенов и программы микологии в Университете Питтсбурга, сообщил Infectious Disease News .

Джейсон П. Бернхэм, доктор медицины , доцент кафедры инфекционных заболеваний Медицинской школы Вашингтонского университета в Сент-Луисе, назвал отчет «большим и масштабным мероприятием, включая дополнительные источники данных для более точной оценки бремя лекарственно-устойчивых инфекций.”

В статье 2018 года Бернхэм и его коллеги предположили, что количество смертей, вызванных лекарственно-устойчивыми инфекциями, может быть почти в семь раз выше, чем старая оценка CDC. Для сравнения, оценки CDC все еще низкие, но Бернхэм объяснил, что это связано с тем, что в его исследовании было более широкое определение лекарственно-устойчивой инфекции, а CDC использовал более свежие данные.

«Уровень внутрибольничных инфекций снизился за последние 10 лет, поэтому это объясняет некоторую разницу», — сказал Бернхэм, не участвовавший в отчете CDC, Infectious Disease News .«Кроме того, они рассчитывают смертность, напрямую связанную с лекарственно-устойчивой инфекцией, то есть это основная причина смерти, — тогда как по нашим оценкам, пациент мог умереть от лекарственно-устойчивой инфекции, но это не обязательно было причиной смерти. первопричина ».

Клэнси, который также не участвовал в отчете CDC, отметил, что методология, использованная агентством для расчета оценок заражения, «очень консервативна», и считает, что цифры все еще выше, чем сообщалось.

«Например, наша группа в Университете Питтсбурга и консорциум DRIVE-AB независимо друг от друга использовали другие методики, чтобы оценить, что существует около 35 000 устойчивых к карбапенемам инфекций Enterobacteriaceae (CRE) — одна из« неотложных угроз »в отчете — ежегодно в США, а не 13 100, по оценке CDC », — сказал он. «Эти расхождения подчеркивают необходимость улучшения национальной и глобальной отчетности и надзора за устойчивостью к антибиотикам, чтобы мы могли строить планы на основе точных цифр и не полагаться на оценки.”

Член Американского общества инфекционных заболеваний Сара Дернберг, доктор медицины, MAS , доцент клинической медицины и медицинский директор по управлению антимикробными препаратами для взрослых в Калифорнийском университете в Сан-Франциско, также охарактеризовала оценки CDC как «консервативные» и сказала, что они были «На основе обнаружения устойчивых бактерий, отвечающих конкретным определениям и внесенных в электронную медицинскую карту».

«Однако это несоответствие подчеркивает необходимость более надежной системы надзора за лекарственно-устойчивыми бактериями», — сказала она.

ПЕРЕРЫВ

В отчет включен список патогенов, которые считаются «неотложными» угрозами общественному здоровью — устойчивые к карбапенемам Acinetobacter , Candida auris , C. difficile , CRE и лекарственно-устойчивые Neisseria gonorrhoeae , а также часы — список патогенов, которые «еще не получили широкого распространения или недостаточно изучены в Соединенных Штатах, но за которыми внимательно следят CDC и другие эксперты в области общественного здравоохранения», — пояснил CDC.К ним относятся устойчивый к азолам Aspergillus fumigatus , устойчивый к лекарствам Mycoplasma genitalium и Bordetella pertussis . Еще 13 патогенов были отнесены к категории «серьезных» или «вызывающих беспокойство» угроз.

Устойчивость к антибиотикам касается не только тех, кто уже заболел или госпитализирован. Уровень энтеробактерий, продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра действия, увеличился в период с 2013 по 2018 год, и, согласно отчету, 47% этих инфекций были связаны с сообществами.

«В отчете четко указывается, что устойчивость к антибиотикам является серьезной проблемой сейчас, а не только тем, о чем следует беспокоиться в будущем; в США, а не только в других странах; и во всех, а не только в людях с серьезными заболеваниями или находящихся на лечении в больницах », — сказал Клэнси.

Принятие мер

Хотя отчет показывает, что в борьбе с лекарственной устойчивостью были достигнуты определенные успехи, необходимы дополнительные действия. По словам Клэнси, необходимы постоянные инвестиции в разработку, надзор и профилактику антибиотиков.

«Я бы посоветовал людям, которые хотят принять участие в борьбе с супербактериями, убедить своих представителей в Конгрессе поддержать Закон о DISARM, который получил двухпартийное спонсорство в обеих палатах Конгресса, как критически важный закон, который обеспечит компенсацию больницам использование новых антибиотиков покрывает затраты на разработку и использование этих лекарств », — сказал он.

В отчете CDC описаны способы защиты населения от резистентности, включая вакцинацию, соблюдение правил гигиены рук, профилактику ЗППП и надлежащее использование антибиотиков.В него также включены задания для ветеринаров.

Бернхэм рассказал, как врачи, практикующие в клинической практике, могут использовать информацию из этого отчета для улучшения своей практики и борьбы с сопротивлением.

«Мы должны и впредь настойчиво назначать антибиотики только тогда, когда это необходимо для максимального снижения лекарственной устойчивости», — сказал он.

Крейг назвал отчет «моментальным снимком» и сказал, что он показывает, что «мы не можем полагаться только на антибиотики».

«Но мы можем принять меры против сопротивления», — сказал он.«Работает профилактика и инфекционный контроль в медицинских учреждениях. У нас уже есть работы по улучшению использования антибиотиков. Работы по правильному обращению с пищевыми продуктами, безопасному сексу, вакцинам и содержанию рук в чистоте ». — Марли Гиззоне

Артикул:

CDC. Угрозы устойчивости к антибиотикам в США, 2019 г. http://www.cdc.gov/drugresistance/Biggest-Threats.html. По состоянию на 13 ноября 2019 г.

Раскрытие информации: Бэбкок, Бернхэм, Крейг и Редфилд не сообщают о раскрытии соответствующей финансовой информации.Клэнси сообщает о получении исследовательских грантов от Astellas, Cidara, Melinta и Merck для проектов, не связанных с отчетом, о работе в консультативных советах или консультировании компаний Astellas, Cidara, Medicines Company, Merck, Needham & Company, Scynexis, Shionogi и Qpex, и выступая на симпозиумах, спонсируемых Merck и T2Biosystems. Дернберг сообщает, что является консультантом компаний Basilia Pharmaceutica и Genentech.

ДОБАВИТЬ ТЕМУ В ОПОВЕЩЕНИЯ ПО ЭЛЕКТРОННОЙ ПОЧТЕ

Получать электронное письмо, когда новые статьи публикуются на

Укажите свой адрес электронной почты, чтобы получать сообщения о публикации новых статей.Подписаться Нам не удалось обработать ваш запрос. Пожалуйста, повторите попытку позже. Если у вас по-прежнему возникает эта проблема, обратитесь по адресу [email protected].

Вернуться в Healio

Единый ресурсный центр здоровья

Зомби-микробы, северные олени и риски для здоровья, связанные с изменением климата

Вспышка сибирской язвы в Сибири заслоняет собой климатические изменения.Но не только олени и их пастухи подвергаются риску из-за потепления климата, — пишет Хилари Бамбрик.

Часть Сибири находится на карантине, где в результате вспышки сибирской язвы погибло 2300 оленей, более 70 человек госпитализированы, а погиб ребенок. Эту вспышку связывают с таянием трупа северного оленя, в котором бактерии сибирской язвы бездействовали в течение 75 лет.

Звучит как эпизод из «Игры престолов», но на самом деле это еще один тревожный сигнал о том, что глобальное потепление вступает в новую тревожную фазу.

Многие люди предполагают, что сибирская язва была создана в лаборатории из-за ее связи с атаками сибирской язвы после 11 сентября, но на самом деле бактерия, вызывающая сибирскую язву, естественным образом встречается в почвах. Заболевание, которое поражает как людей, так и животных, возникает, когда споры бактерии сибирской язвы попадают внутрь организма — через вдыхание, проглатывание или контакт с поврежденной кожей — это заболевание может быть спровоцировано.

Зомби-микробы

Животные могут подвергаться воздействию спор сибирской язвы при выпасе или питье зараженной воды, а для предотвращения вспышек можно использовать вакцинацию домашних стада в пострадавших районах.Заражение людей происходит редко и обычно ограничивается контактом с инфицированными животными или продуктами их переработки.

Почему эта вспышка в Сибири произошла сейчас, после целой жизни отсутствия? Наиболее вероятная причина — глобальное потепление.

Споры бактерии сибирской язвы могут находиться в состоянии покоя в течение очень долгого времени — своего рода спячка. Подобно тому, как морозильная камера сохраняет пищу, ледяная арктическая тундра сохраняет мясо северного оленя и спящие споры сибирской язвы.

Недавние рекордные температуры в регионе — более чем на 5 градусов по Цельсию выше среднего — привели к таянию вечной мерзлоты, так что споры недавно сгнивших мертвых оленей вымываются в грунтовые воды.Эта загрязненная вода потребляется оленями и людьми, вызывая попадание спор. Возможно, еще более тревожным является то, что нынешняя вспышка может быть связана не с одним зараженным оленем, а с разложением человеческой плоти на размораживаемых кладбищах.

Глобальные температуры повышаются из-за деятельности человека. 2016 год почти наверняка станет самым жарким годом за всю историю наблюдений в мире третий год подряд, а июнь стал четырнадцатым месяцем подряд, чтобы побить месячные температурные рекорды.Повышение температуры — серьезная причина для беспокойства о здоровье человека.

Не только олени и их пастухи подвержены риску болезней, вызванных изменением климата; ряд серьезных инфекционных заболеваний обусловлен климатом.

Болезни, обусловленные климатом

Температура и количество осадков влияют на развитие инфекции или ее смерть. Это может быть связано с прямым воздействием на патоген (вызывающий заболевание организм) или с обеспечением среды, необходимой для поддержания переносчиков болезней, таких как клещи и комары, или альтернативных хозяев болезней, таких как летучие мыши и крысы.

Как и сибирская язва, передача ряда других бактериальных болезней связана с изменением климата. Например, лептоспироз переносится млекопитающими и может передаваться людям при контакте с мочой животных. Воздействие бактерий Leptospira через загрязненные паводковые воды, вероятно, увеличится в некоторых районах с усилением экстремальных погодных условий, связанных с изменением климата.

Бактериальный гастроэнтерит, например, вызванный бактериями Salmonella, чаще встречается в теплые месяцы, и ожидается, что число случаев заболевания будет расти по мере дальнейшего повышения температуры.Это связано с тем, что бактерии быстрее размножаются в зараженной пище и на поверхностях для приготовления пищи, когда она теплее.

Могут быть затронуты даже кожные инфекции, вызванные бактериями. Тропические язвы, вызванные различными бактериями, возникают в теплых влажных условиях. Повышение температуры, особенно в сочетании с повышением влажности, может увеличить вероятность и масштаб вспышек.

Болезни, переносимые комарами, такие как малярия, зика, денге и чикунгунья, могут передаваться только в районах, где климат благоприятен для комаров, которые их переносят.Более высокие температуры означают, что комары быстрее созревают, чаще питаются и живут дольше. Болезни, которые они переносят, распространятся в новые географические районы и будут передаваться легче.

Сезоны наибольшего распространения этих болезней удлиняются по мере того, как зимы становятся теплее и короче. Короче говоря, все более благоприятный климат для комаров приводит к увеличению передачи болезней. В то время как наиболее серьезные вспышки, вероятно, произойдут в местах, институционально менее способных к ответным мерам, даже в странах с хорошими ресурсами бороться с этими заболеваниями становится труднее.

Это повторное появление давно ушедшей смертельной болезни после рекордно высоких температур в Сибири напоминает нам о хрупкости взаимоотношений между людьми, окружающей средой и микробами, с которыми мы сосуществуем. Изменение климата вызовет новые, разрушительные и, возможно, плохо ожидаемые проблемы для здоровья, с которыми нам придется справляться.

Хилари Бамбрик — климатический эпидемиолог и член Совета по климату.

У Хиллари Клинтон классический случай ходячей пневмонии?

Шаткий инцидент с Хиллари Клинтон в воскресенье — почти хрестоматийный случай того, что может случиться с «ходячей пневмонией»: пациенты плохо себя чувствуют, но они недостаточно больны, чтобы оставаться дома в постели или быть госпитализированными.

Клинтон вызвала долгие слухи, когда она покинула поминальную службу 11 сентября в Нью-Йорке в воскресенье утром и увидела, как ее посадили во внедорожник, но она не слишком устойчива.

Оказывается, это была пневмония и обезвоживание, сказала доктор Лиза Бардак, которая обследовала ее в своем доме в Чаппакуа.

У нее это было какое-то время.

«Госсекретарь Клинтон испытывает кашель, связанный с аллергией. В пятницу, во время последующего осмотра ее продолжительного кашля, ей был поставлен диагноз пневмония», — говорится в заявлении Бардак.

«Ей назначили антибиотики, посоветовали отдохнуть и изменить свой график. Во время утреннего мероприятия она перегрелась и обезвожилась. Я только что осмотрел ее, теперь она восстанавливается и восстанавливается».

Ник Меррилл, представитель Клинтона, сказал, что Клинтон останется в своем доме в Чаппакуа, штат Нью-Йорк, чтобы отдохнуть. По его словам, запланированная поездка в Калифорнию на мероприятия в понедельник и вторник была отменена.

Пневмония может быть вызвана вирусами или бактериями и относится к инфекции, которая попадает в легкие.Бактериальная пневмония — обычное явление, обычно несерьезное и легко поддается лечению антибиотиками.

Эти легкие бактериальные инфекции могут вызывать кашель, а иногда и легкую лихорадку.

Люди часто чувствуют себя достаточно хорошо, чтобы заниматься своими делами, особенно после того, как они начали принимать антибиотики. И если они принимают антибиотики в течение дня или около того, они вряд ли заразят кого-либо еще.

Но инфекция может нанести серьезный ущерб, делая пациентов склонными к утомлению и обезвоживанию. А поскольку люди часто не осознают, что у них есть инфекция, они могут пройти несколько дней или недель, прежде чем обратиться за лечением — все время, чтобы инфекция изнашивала их еще больше.

Связано: заразна ли пневмония?

Существует вакцина, предназначенная для защиты людей старше 65 лет от вызывающих пневмонию стрептококковых бактерий, но многие другие бактерии, от Staphylococcus до Mycoplasma pneumoniae , могут вызывать пневмонию.